Kaggle競(jìng)賽賽題解析：胃腸道圖像分割

Kaggle是一個(gè)舉辦機(jī)器學(xué)習(xí)學(xué)術(shù)活動(dòng)的社區(qū)，一個(gè)可以很好的發(fā)展和實(shí)踐你的技能以及展示你的能力的機(jī)器學(xué)習(xí)與數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。對(duì)于想?yún)⒓覭aggle學(xué)術(shù)活動(dòng)的初學(xué)者將是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)，今天我們來(lái)看看Kaggle學(xué)術(shù)活動(dòng)賽題解析：胃腸道圖像分割。

比賽名稱：UW-Madison 胃腸道圖像分割

在醫(yī)學(xué)掃描中跟蹤健康器官以改善癌癥治療

比賽鏈接：https://www.kaggle.com/competitions/uw-madison-gi-tract-image-segmentation

比賽類型：計(jì)算機(jī)視覺(jué)、語(yǔ)義分割

比賽背景

2019 年，全球估計(jì)有 500 萬(wàn)人被診斷出患有胃腸道癌癥。在這些患者中，大約一半有資格接受放射治療，通常每天進(jìn)行 10-15 分鐘，持續(xù) 1-6 周。放射腫瘤學(xué)家嘗試使用指向腫瘤的 X 射線束進(jìn)行高劑量輻射，同時(shí)避開(kāi)胃和腸。

借助集成磁共振成像和線性加速器系統(tǒng)（也稱為 MR-Linacs）等新技術(shù)，腫瘤學(xué)家能夠可視化腫瘤和腸道的每日位置，這些位置每天都在變化。在這些掃描中，放射腫瘤學(xué)家必須手動(dòng)勾勒出胃和腸的位置，以便調(diào)整 X 射線束的方向，以增加向腫瘤輸送的劑量并避開(kāi)胃和腸。這是一個(gè)耗時(shí)且勞動(dòng)密集型的過(guò)程，可以將治療從每天 15 分鐘延長(zhǎng)到每天一個(gè)小時(shí)，這對(duì)于患者來(lái)說(shuō)可能難以忍受——除非深度學(xué)習(xí)可以幫助自動(dòng)化分割過(guò)程。分割胃和腸的方法將使治療更快，并使更多患者獲得更有效的治療。

比賽任務(wù)

在本次比賽中，您將創(chuàng)建一個(gè)模型以在 MRI 掃描中自動(dòng)分割胃和腸。MRI 掃描來(lái)自實(shí)際的癌癥患者，他們?cè)诜派渲委熎陂g的不同日子進(jìn)行了 1-5 次 MRI 掃描。

您將基于這些掃描的數(shù)據(jù)集制定您的算法，以提出創(chuàng)造性的深度學(xué)習(xí)解決方案，幫助癌癥患者獲得更好的護(hù)理。

評(píng)價(jià)指標(biāo)

Hausdorff 距離是一種計(jì)算分割對(duì)象 A 和 B 之間距離的方法，通過(guò)計(jì)算對(duì)象 A 上的最遠(yuǎn)點(diǎn)到對(duì)象 B 上的最近點(diǎn)。

對(duì)于 3D Hausdorff，我們通過(guò)將每個(gè) 2D 分割與切片深度相結(jié)合來(lái)構(gòu)造 3D 體積作為Z坐標(biāo)，然后找到它們之間的Hausdorff距離。

數(shù)據(jù)描述在本次比賽中，我們?cè)趫D像中分割器官細(xì)胞。訓(xùn)練注釋以 RLE 編碼掩碼的形式提供，圖像采用 16 位灰度 PNG 格式。

本次比賽中的每個(gè)案例都由多組掃描切片表示。有些案例是按時(shí)間拆分的，而有些案例是按案例拆分的——整個(gè)案例都在訓(xùn)練中或測(cè)試中。本次比賽的目標(biāo)是能夠推廣到部分和完全未見(jiàn)的案例。

train.csv - 所有訓(xùn)練對(duì)象的 ID 和掩碼。

sample_submission.csv - 格式正確的示例提交文件。

train - 案例/日文件夾的文件夾，每個(gè)文件夾包含給定日期特定案例的切片圖像。

比賽賽程

2022年7月7日：報(bào)名截止日期。您必須在此日期之前接受比賽規(guī)則才能參加比賽。

2022年7月7日：團(tuán)隊(duì)合并截止日期。這是參與者加入或合并團(tuán)隊(duì)的最后一天。

2022年7月14日：最終提交截止日期。

賽題獎(jiǎng)金

1st Place - $12,000

2nd Place - $8,000

3rd Place - $5,000

解題思路賽題是一個(gè)典型語(yǔ)義分割賽題，因此可以參考?xì)v史的語(yǔ)義分割模型和3D語(yǔ)義分割比賽。

掃碼獲取備賽計(jì)劃，考前查缺補(bǔ)漏、重點(diǎn)沖刺

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