Kaggle競賽賽題解析：HuBMAP 醫(yī)學(xué)器官分割

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比賽名稱：HuBMAP + HPA - Hacking the Human Body 分割多器官功能組織單元

比賽鏈接：https://www.kaggle.com/competitions/hubmap-organ-segmentation

比賽類型：計算機視覺、語義分割

比賽背景人類生物分子圖譜計劃(HuBMAP) 正在努力在細胞水平上創(chuàng)建人類參考圖譜，旨在繪制人類細胞、組織和器官中的蛋白質(zhì)表達圖。

在本次比賽中，您將識別和分割五個人體器官的功能性組織單位 (FTU)。您將使用組織切片圖像數(shù)據(jù)集構(gòu)建模型，并盡可能準(zhǔn)確地分割 FTU。如果成功，您將有助于加速世界對細胞和組織組織之間關(guān)系的理解。

比賽任務(wù)您將使用組織切片圖像數(shù)據(jù)集構(gòu)建模型，并盡可能準(zhǔn)確地分割器官功能組織單元。

評價指標(biāo)使用 Dice coefficient進行評價，通過對比真實標(biāo)簽與選手提交的預(yù)測結(jié)果：

數(shù)據(jù)描述訓(xùn)練數(shù)據(jù)集由來自公共 HPA 數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)組成，公共測試集是私有 HPA 數(shù)據(jù)和 HuBMAP 數(shù)據(jù)的組合，私有測試集僅包含 HuBMAP 數(shù)據(jù)。

[train/test].csv：訓(xùn)練/測試集的元數(shù)據(jù)

[train/test]_images/：訓(xùn)練/測試集的圖像

train_annotations/：訓(xùn)練集標(biāo)簽

比賽賽程

2022年9月15日：報名截止日期。您必須在此日期之前接受比賽規(guī)則才能參加比賽。

2022年9月15日：團隊合并截止日期。這是參與者加入或合并團隊的最后一天。

2022年9月22日：最終提交截止日期。

賽題獎金

1st Place - $15,000

2nd Place - $10,000

3rd Place - $5,000

解題思路賽題是典型的語義分割賽題，需要使用語義分割的模型來完成。在完成的過程需要考慮對圖像進行切分，搭建魯邦的模型。

參考思路：https://www.kaggle.com/code/realneuralnetwork/fork-of-inference-fastai-baseline

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